HLA分型 HLA-typing

HLA (Human Leukocyte Antigen人类淋巴细胞抗原)人类体内抗原呈递的主要组成部分,其中的A,B,C,DP,DQ,DR等位点,每个都发现了几百至几千种等位基因。而个体所表达的HLA亚型,不但决定其展示哪些多肽片段,展示多肽抗原的数目,而且同时作为抗原的一部分,与T细胞受体(TCR)结合。检测一个个体的HLA分型无论是对生物研究还是该个体的免疫相关诊断治疗,都是不可缺少的。

优势对比

目前市场上较多的平台基于NGS测序,其优势在于覆盖面较广(一类和二类),但同时受限于处理时间较长,费用较高和准确率无法达到最高。我们采用了基于Sanger测序的传统方法,采用自主研发专利,在设计和算法上进行了优化。能够充分利用其高准确性,反应快速和相对廉价的优势,达到精准快速的单位点测序。目前我们的服务可以覆盖HLA的A, B, C, DRB1和DQB1亚型。

HLA是抗原的重要部分,和TCR大范围接触​​

HLA (Human Leukocyte Antigen) 是人体内抗原呈递的主要组成部分。其中的A,B,C,DP,DQ,DR等位点,每个都发现了几百至几千种等位基因。而个体所表达的HLA亚型,不但决定其展示哪些多肽片段,展示多肽抗原的数目,而且同时作为抗原的一部分,与T细胞受体(TCR)结合。检测一个个体的HLA分型对于无论是对生物研究还是对该个体的免疫相关诊断治疗,都是不可缺少的。

HLA,多肽和TCR

HLA-多肽-TCR 三者的组合是研究T细胞免疫科学的核心HLA因为分型不同可有多种变化,它是决定多肽和TCR特异性的重中之重。

HLA运用

多篇文献中都提到HLA的 重要性,其中对一些常见HLA分型有偏重,例如:HLA-A0201;HLA-B2705等,会有多组已知的清楚多肽序列可供使用若想运用上述成果,必须知道实验对象的HLA。

HLA 高分辨型技术

最新HLA高分辨分型技术,使建立高分辨HLA数据库成为可能,不仅有利于快速准确地找到合适供者,大大地提高骨髓库的使用率,使其更好的服务于患者,而且可以为HLA的科学研究与技术创新提供基础性的数据支持。

自主专利算法

示例为抽选样本编号TY,整个实验过程时间短,分析结果准确性高,可解决普通NGS测序结果不精确的情况。

HLA-I型中 由α、β两条多肽链组成;α链为重链,由MHC编码; α1 α2 为可变区是抗原结合部位,也是T细胞抗原受体的识别部位, α3 为T细胞分化Ag CD8的识别部位,即T细胞CD8是I类抗原的受体,对CTL的识别限制。提呈内源性抗原. 在我们的测序算法中可以完全覆盖HLA-I型中的外显子2(对应a1链);外显子3(对应a2链);外显子4(对应a3链).保证HLA分型中重要的部分全部检测到位。

HLA-II型中主要组织相容性复合体由一个α链和一个β链组成,两个链都穿过整个细胞膜。在细胞外这个分子有四个区(α1、α2、β1和β2),其中α1和β1组成一个凹坑。第二型主要组织相容性复合体比第一型主要组织相容性复合体稍大些。只有吞噬性的细胞(比如吞噬细胞)的表面有第二型主要组织相容性复合体(第二型人类白细胞抗原)。这个型的分子又可以下分为HLA-DQ、HLA-DR等。

普通NGS测序 VS Sanger测序 (HLA-I/II类)

示例为抽选样本TY进行的NGS测序,分别用三种不同的程序检测HLA-Typing分型。过程中耗费时间长,还经常遇到结果出现不一致的现象。目前常用的基于NGS的HLA分型算法,在第二位只能达到97%的准确率,而在第四位只有93%。

示例报告

在报告中会为您提供初步的数据分析结果,及测序和分析位点做验证参考。最终会给出我们基于分析的建议结果。

发明专利